📄 synthetic biology

Transient contractility attenuation reprograms epithelial cells into a protrusion-driven state that drives tissue fluidization

एक्टोमायोसिन संकुचनता (actomyosin contractility) का क्षणिक क्षीणन, साइटोस्केलेटल, आसंजक (adhesive) और ERK सिग्नलिंग परिवर्तनों को समन्वित करके, संलयित उपकला कोशिकाओं (confluent epithelial cells) को एक उभार-संचालित, लीडर-जैसे अवस्था में पुनर्गठित करता है, जिससे ठोस-समान से तरल-समान ऊतक व्यवहार में संक्रमण प्रेरित होता है।

WP, S., Liu, S., Nguyen, T. P., Mishra, P. K., Pratiman, D., Gupta, A. S., Hirashima, T.2026-03-25
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Optimization of PURE system composition using automation and active learning

यह अध्ययन PURE प्रोटीन संश्लेषण प्रणाली की संरचना को कुशलतापूर्वक अनुकूलित करने के लिए ऑटोमेटेड लिक्विड हैंडलिंग को एक एक्टिव लर्निंग फ्रेमवर्क के साथ जोड़ता है, जिससे 3-गुना तक उपज में सुधार प्राप्त हुआ और यह भी पता चला कि इष्टतम फॉर्मूलेशन (formulations) DNA सांद्रता-निर्भर और जीन-विशिष्ट हैं।

Bernard-Lapeyre, Y., Cleij, C., Sakai, A., Huguet, M.-J., Danelon, C.2026-03-25
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CombinGym: a benchmark platform for machine learning-assisted design of combinatorial protein variants

यह शोधपत्र CombinGym को प्रस्तुत करता है, जो एक बेंचमार्क प्लेटफॉर्म है जिसमें 14 क्यूरेटेड डेटासेट और मशीन लर्निंग एल्गोरिदम का एक व्यापक मूल्यांकन शामिल है ताकि कॉम्बिनेटोरियल प्रोटीन डिज़ाइन में अंतराल को दूर किया जा सके, जो यह प्रदर्शित करता है कि लोअर-ऑर्डर म्यूटेशन डेटा का लाभ उठाना उच्च-क्रम के प्रोटीन वेरिएंट के पूर्वानुमान और प्रयोगात्मक इंजीनियरिंग में महत्वपूर्ण सुधार करता है।

Chen, Y., Fu, L., Lu, X., Li, W., Gao, Y., Wang, Y., Ruan, Z., Si, T.2026-03-25
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Engineering bacterial combinatorial promoters for two-input chemical AND switching

यह अध्ययन *Escherichia coli* में एक व्यवस्थित इंजीनियरिंग दृष्टिकोण प्रस्तुत करता है जो ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर सेंसरों को अनुकूलित करके और लीकीनेस (leakiness) को दबाने तथा कॉम्बिनेटोरियल प्रमोटरों में अनुक्रम-संदर्भ निर्भरताओं (sequence-context dependencies) को प्रबंधित करने के लिए महत्वपूर्ण डिजाइन नियम स्थापित करके सफलतापूर्वक सुदृढ़ टू-इनपुट AND लॉजिक स्विच बनाता है।

Prakash, S., Jaramillo, A.2026-03-25
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Substrate transport limits phenylalanine ammonia-lyase activity in engineered Lacticaseibacillus rhamnosus GG

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जबकि *Lacticaseibacillus rhamnosus* GG चिकित्सीय फेनिलएलनिन अमोनिया-लायज़ (phenylalanine ammonia-lyase) को व्यक्त करने के लिए सबसे प्रभावी होस्ट है, इसकी गतिविधि मुख्य रूप से सबस्ट्रेट परिवहन द्वारा सीमित है, जिसे रासायनिक सर्फेक्टेंट उपचार के बजाय हेटरोलॉगस ट्रांसपोर्टर्स की अभिव्यक्ति के माध्यम से महत्वपूर्ण रूप से (3-4 गुना) बढ़ाया जा सकता है।

Choudhury, D., Mays, Z. J., Nair, N. U.2026-03-20
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The Cepeda Framework: A Modular, Safety-First Preclinical Architecture for Testing Coordinated Multi-Hallmark Rejuvenation Hypotheses in Biological Aging

सेपेडा फ्रेमवर्क (Cepeda Framework) एक मॉड्यूलर, सुरक्षा-प्रथम प्रीक्लिनिकल आर्किटेक्चर है जो बुढ़ापे के सभी बारह आधिकारिक लक्षणों में आंशिक कायाकल्प को समन्वित करने के लिए पांच नियामक सिद्धांतों और पांच साथी प्रोटोकॉल को एकीकृत करता है, जो अनियंत्रित प्लुरिपोटेंसी (pluripotency) को रोकने के लिए 21,000 कम्प्यूटेशनल सिमुलेशन चक्रों के माध्यम से मान्य 3:2:1 OCT4:SOX2:KLF4 स्टोइकीओमेट्रिक अनुपात और एक नौ-सुरक्षा कवच वाले 'डिफेंस-इन-डेप्थ' सिस्टम का उपयोग करता है।

Cepeda, C. J.2026-03-19
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A genetically encoded local learning rule enables physical learning in engineered bacteria

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि इंजीनियर की गई *E. coli* प्लाज्मिड कॉपी-नंबर अनुपातों को स्थायी स्मृति के रूप में उपयोग करके एक आनुवंशिक रूप से कूटबद्ध स्थानीय शिक्षण नियम को लागू कर सकती है, जो लॉजिक गेट्स से लेकर स्वायत्त जैविक हार्डवेयर तक के अनुप्रयोगों के लिए एकल और बहुकोशिकीय जीवाणु आबादी में भौतिक शिक्षण और पर्यवेक्षित अनुकूलन को सक्षम बनाती है।

Prakash, S., Varela, C., Walsh, M., Galizi, R., Isalan, M., Jaramillo, A.2026-03-19
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A Toolbox for Biomanufacturing of Functionalised PHA Nanoparticles with C. necator

यह अध्ययन *Cupriavidus necator* में एक व्यापक आनुवंशिक और प्रक्रिया इंजीनियरिंग प्लेटफॉर्म स्थापित करता है जो ट्यूनेबल सामग्री गुणों वाले कार्यात्मक PHA नैनोकणों के अनुकूलन योग्य बायोमैन्युफैक्चरिंग, सह-संवर्धन (co-culturing) के माध्यम से उन्नत उत्पादन उपज, और बायोमेडिसिन एवं स्थिरता में विविध अनुप्रयोगों के लिए सतह बायो-संयुग्मन (surface bioconjugation) क्षमताओं को सक्षम बनाता है।

Allan, J., Zillig, L. J. K., Della Valle, S., Steel, H.2026-03-18
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Behavioral, Physiological, and Transcriptional Mechanisms of Memory in a Synthetic Living Construct

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि बेसल जेनोबॉट्स (Xenobots), जो जेनोपस (Xenopus) भ्रूण कोशिकाओं से प्राप्त सिंथेटिक जीवित संरचनाएं हैं, विशिष्ट रासायनिक उत्तेजनाओं के संपर्क में आने के बाद समन्वित सिलियरी गतिविधि, कैल्शियम सिग्नलिंग और ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तनों के माध्यम से विशिष्ट, दीर्घकालिक, उत्तेजना-विशिष्ट स्मृतियाँ प्रदर्शित कर सकते हैं, जिससे सिंथेटिक सेलुलर संग्रहों में गैर-तंत्रिका सूचना प्रसंस्करण को समझने की एक नींव स्थापित होती है।

Pai, V. P., Traer, J. A., Sperry, M. M., Zeng, Y., Levin, M.2026-03-17
📄 synthetic biology

Selection-free whole genome transplantation revives dead microbes

यह अध्ययन एक चयन-मुक्त संपूर्ण जीनोम प्रत्यारोपण पद्धति को प्रदर्शित करता है जो एक सिंथेटिक जीनोम स्थापित करके रासायनिक रूप से निष्क्रिय मृत जीवाणु कोशिकाओं को पुनर्जीवित करता है, जिससे निर्जीव भागों से पहली जीवित सिंथेटिक कोशिका का निर्माण होता है और विविध जीवाणु प्रजातियों में इस तकनीक के विस्तार की पिछली बाधाओं को दूर किया जाता है।

Seidel, Z. P., Assad-Garcia, N., Paralanov, V., Wu, F., Chao, O., Strychalski, E. A., Romantseva, E. F., Goshia, T., Ven (…)2026-03-14